2007년 초, '엔젤하이로'(Angelhalo)라는 커뮤니티 웹사이트 내에 새롭게 설치된 제로보드 기반 위키위키에서 시작했다. 2007년 3월 1일, 오위키 기반으로 변경하여 한국어 위키로 변모하였으며, 2008년 12월 12일부터는 다시 모니위키 기반으로 위키 엔진을 변경하였다.
2012년 3월 9일, 엔젤하이로 운영자인 '함장'이 사용자 '청동'에게 엔하위키를 양도함에 따라 엔하위키와 엔젤하이로는 완전히 분리되었다. 분리와 동시에 서버를 이전하면서 도메인이 '리그베다 위키'(Rigveda Wiki)로 바뀜에 따라 공식 이름도 함께 변경되었으나, 엔하위키라는 명칭도 통용되었다. 하지만 엔젤하이로가 또다른 엔하위키를 만들고, 2013년 5월에는 게시판도 완전히 분리되면서, 더 이상 '엔하위키'란 명칭은 리그베다 위키에서는 사용되지 않게 되었다. 하지만 엔하위키 미러는 이름을 바꾸지 않았기 때문에, 여전히 엔하위키라는 명칭이 혼용되고 있다.
그러나 2015년 4월 8일, 리그베다 위키 영리화 사태로 인해 위키의 정상적인 열람과 편집이 불가능할 정도로 파행이 일어났다. 또한 사이트 공격으로 인한 복합적인 사태로 인해 결국 2015년 4월 25일 서버가 다운되어 운영이 잠시 중단되었다.